德运康瑞在国内率xian推出具有亚细胞高分辨率的空间原位测序(ISS)技术,并与多家顶尖医院临床转化合作,有望成为革命性的临床病理工具。SEERNA® ISS产品解决方案依赖于双连接探针杂交、滚环扩增(RCA)和多轮荧光显微拍照等实验过程,一次性可以在组织原位检测数百种RNA分子。该技术同时具有组织原位检出、灵敏度高、特异性强等技术优势,兼容新鲜冰冻和临床FFPE组织样本,可在单细胞分辨率下,解析高度复杂的细胞和分子特征,精确解析还原组织微环境特征及变化。目前已经针对肿瘤研究推出了两款Panel,帮助用户精细化解析肿瘤微环境特征,定义细胞类型和功能状态,用户可以在此基础上添加个性化靶标;德运康瑞也是国内最早提供原位测序技术服务的公司,在人、小鼠等物种的近百种组织类型上积累了丰富的项目经验,并助力客户发表了Cell、Nature Neurosicence等多篇高分项目文章。德运康瑞的原位测序产品(SEERNA ISS)作为国nei首ge落地商业化平台,拥有丰富的经验积累和扎实的技术性能,引lin着国产空间组学技术发展。
SEERNA® ISS支持完quan个性化探针定制,并且已推出了肿瘤微环境Panel和泛癌种Cell Marker Panel(human),其中肺癌肿瘤微环境Panel涵盖肺癌中主要细胞类型marker、肿瘤增殖和EMT相关、免疫检查点以及抗原递呈相关的98个核心RNA以及3个靶标蛋白,可以实现肺癌组织肿瘤微环境分子表达和细胞组成表征,辅助发现新的治疗靶点和Biomarker;泛癌种Cell Marker Panel针对肿瘤组织中主要细胞类型的筛选了51个经典cell marker genes设计,可以实现肿瘤样本中主要细胞类型注释和微环境解析,并且成功验证了结直肠癌、乳腺癌、宫颈癌、肺癌、肝癌及胃腺癌等样本类型。
DynaSpatial是德运康瑞基于3D高密度创新修饰等技术开发的空间转录组产品,DynaSpatial技术文章已发表在Nature Biotechnology (影响因子46.9)期刊,已推出常规透化捕获方案和基于探针法捕获的FFPE解决方案,优异的基因检出性能广受认可;常规透化捕获方案适合新鲜冰冻OCT包埋样本(FF样本),理论上没有物种限制,而探针法捕获主要针对人和小鼠物种设计18000~19000基因的探针库,通过DynaBlot仪器完成探针杂交产物转移捕获,实现临床FFPE样本(兼容FF样本)的空间转录组研究分析。DynaSpatial 空间转录组产品解决方案涵盖丰富,不仅拥有高基因检出率和低弥散的优异性能,更得到了顶级期刊文章的验证,基因检测性能已达到国际lin先水平,增强了南宫ng娱乐官网中国智造的信心。
DynaSpatial捕获芯片现已推出常规分辨率(spot 50 μm,芯片规格有5mm×5mm、7.5 mm×7.5mm 和 10 mm×10mm )和高分辨率(spot 15 μm,芯片规格有HD 3mm×3mm、HD 6mm×6mm)两种芯片,让不同研究领域样本类型需求可以匹配最佳的面积及分辨率。
DynaSpatial 捕获芯片的分辨率和面积规格
来自广州国家实验室的田鲁亦研究员和西湖大学的刘晓东团队联合了墨尔本大学、哈佛大学研究者在Nature Methods(影响因子36.1)上发表了研究论文Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods对 11 种基于测序的空间转录组技术方法进行了全面比较, 其中包括DynaSpatial技术的评测, 并验证了DynaSpatial在相同的测序深度下表现出更好的捕获效率,以下是在本次测评中DynaSpatial在不同样本类型中的数据表现。